من بين البحيرات الرئيسية في اليونان بحيرات Prespa ، وهما بحيرتان للمياه العذبة ، شمال Pindo massif ، تشترك البحيرة في تدفقها مع البلدان المجاورة مثل ألبانيا وجمهورية مقدونيا واليونان. وهي أعلى البحيرات التكتونية في البلقان بارتفاع 853 مترًا. قريب جدا من هناك بحيرة ميكرا بريسبا تبلغ مساحتها 43 مترًا مربعًا فقط ، الجزء الأدنى يخص ألبانيا والباقي لليونان.
El ميجالي بريسبا وهي الأكبر بمساحة 1.038 مترًا مربعًا ، جزء صغير فقط ينتمي إلى اليونان وجزء صغير آخر ينتمي إلى ألبانيا والجزء الأكبر ينتمي إلى مقدونيا. كما توجد بحيرات صغيرة جميلة بين الجبال مثل بحيرة كاستوريا التي تبلغ مساحتها 2 كيلومترًا مربعًا ، ويتراوح عمقها بين 28 و 2 أمتار ، وتشترك في سطحها مع وادي عليكمون المرتفع ، وتقع على شواطئ مدينة كاستوريا. تقع بحيرة Vegorritis بين كتل Voras و Vermion. ال بحيرة دويرانيس إنها مصنوعة من المياه المالحة ، ولكن عندما لا تتواصل مع البحر لسبب ما ، فإنها تبدأ في أن تكون بحيرة مياه عذبة بسبب اتصالها بالمياه الجوفية.
على حافة الوادي أووس هناك بحيرتان ذات مياه دائمة ، على ارتفاع 2.000 متر ، يقولون أنها سر الجبال. تعيش في هذه البحيرات جبال الألب Triturus ، وهي عبارة عن تنانين صغيرة من Epirus. تقع بحيرات Zistonis في شرق خليج Nestos. عند مصب نهر ألفيوس توجد بحيرة أكولينيتسا. بجانب مدينة أجرينيون توجد بحيرة Trikhonis ، وهي تقع بين جبال شمال خليج باتراس.