Görögország fő tavai közé tartozik a Prespa-tó, amely két édesvízi tó, a Pindo-hegytől északra, a tó megosztja az áramlását a szomszédos országokkal, Albánia, Macedónia és Görögország. 853 méter magasan a Balkán legmagasabb tektonikus tavai. Nagyon közel van a Mikra Prespa tó Ez csak 43 m2, és a legkisebb rész Albániához, a többi Görögországhoz tartozik.
El megali prespa amely a legnagyobb 1.038 m2-rel, csak egy kis része Görögországé, egy másik kisebb része Albániához, a legnagyobb része pedig Macedóniához tartozik. A hegyek között gyönyörű kicsi tavak is találhatók, mint például a Kastoría-tó, amelynek területe 28 km2, mélysége 9 és 10 méter között van, felszínét megosztja az Aliákmon magas völgyével, és a Kastoria városa. A Vegorritis-tó a Voras és a Vermion hegység között helyezkedik el. A Doiranis-tó Sós vízből készül, de amikor valamilyen oknál fogva nem kommunikál a tengerrel, a talajvízzel való kommunikáció miatt édesvizű tóvá válik.
A kanyon szélén Évek két állandó vizű tó van, 2.000 méteres magasságban, azt mondják, hogy a hegyek titka. Ezekben a tavakban az alpesi Triturus él, amelyek Epirus kis sárkányai. A Nestosz-öböltől keletre találhatók a Zistonis-tavak. Az Alfiós torkolatánál található az Aqulinitsa-tó. Agrínion városa mellett található a Trikhonis-tó, a Patras-öböltől északra fekvő hegyek között található.