All'interno della variegata geografia dell'isola, spiccano i suoi innumerevoli fiumi, che sono l'attrazione degli amanti della natura.
In questo senso, il Fiume Almendares , che è un affluente di 45 km nella parte occidentale di Cuba. Proviene da Tapaste orientale e scorre a nord-ovest nello Stretto della Florida. Il fiume funge da fonte d'acqua per l'Avana.
In particolare, ci sono diversi impianti industriali lungo le rive del fiume (cartiere, impianti di produzione di gas, birrerie, impianti di produzione alimentare, impianti di costruzione). La zona sta diventando un'oasi verde con parco giochi, diversi ristoranti, percorsi pedonali.
Anche attraente è il Fiume Cauto, situato nel sud-est di Cuba, e che è il fiume più lungo di Cuba. Scorre per una lunghezza totale di 230 miglia (370 km) dalla Sierra Maestra a ovest e nord-ovest ed entra nel Mar dei Caraibi settentrionale da Manzanillo. Tuttavia, fornisce solo 70 miglia (110 km) di trasporto fluviale.
Attraversa le province di Santiago de Cuba e Granma e lungo il fiume si trovano le comunità di Palma Soriano, Cristo de Río Cauto e Cauto. È uno dei due fiumi navigabili a Cuba. L'altro si chiama Sagua la Grande.
Infine, l' Toa River, è un fiume situato nella provincia di Guantánamo de Cuba. Attraversa il paese ed è lungo 131 chilometri e ha 72 affluenti. Il fiume Toa è ben noto per le sue acque cristalline.
Il bacino del fiume Toa si estende per 1,061 chilometri quadrati (0.410 miglia quadrate) e ha una pendenza media di 260 metri (850 piedi). Occupa circa il 70% della Riserva della Biosfera di Cuchillas del Toa. L'area intorno al fiume ospita molte specie di flora e fauna endemiche, tra cui almeno 1000 specie di fiori e 145 specie di felci.
Ci sono specie in via di estinzione, come il Tocororo (che è anche l'uccello nazionale di Cuba) e il falco, anch'essi fanno parte della fauna di questa zona.