Tarp pagrindinių Graikijos ežerų yra Prespos ežerai, kurie yra du gėlo vandens ežerai, į šiaurę nuo Pindo masyvo. Ežeras savo srautu dalijasi su kaimyninėmis šalimis Albanija, Makedonijos Respublika ir Graikija. Tai aukščiausi tektoniniai ežerai Balkanuose, kurių aukštis siekia 853 metrus. Labai arti yra Mikra Prespa ežeras Tai tik 43 m2, o minimali dalis priklauso Albanijai, likusi dalis - Graikijai.
El megali prespa kuri yra didžiausia su 1.038 m2 ploto, tik nedidelė dalis priklauso Graikijai, kita maža - Albanijai, o didžioji dalis - Makedonijai. Tarp kalnų taip pat yra nuostabių mažų ežerų, tokių kaip Kastoría ežeras, kurio plotas yra 28 km2, o jo gylis yra nuo 9 iki 10 metrų, jo paviršius dalijasi su aukštu Aliákmono slėniu ir yra ant kranto. Kastorijos miestas. Vegorrito ežeras yra tarp Voros ir Vermiono masyvų. Doiranio ežeras Jis yra sūraus vandens, tačiau kai dėl kokių nors priežasčių jis nebendrauja su jūra, jis tampa gėlo vandens ežeru dėl bendravimo su požeminiu vandeniu.
Kanjono pakraštyje Metai yra du ežerai su nuolatiniais vandenimis, 2.000 metrų aukštyje, jie sako, kad jie yra kalnų paslaptis. Šiuose ežeruose gyvena Alpių Triturus, kurie yra maži Epiro drakonai. Į rytus nuo Nestos įlankos yra Zistonio ežerai. Alfiós žiotyse yra Akulinicos ežeras. Šalia Agríniono miesto yra Trikhonis ežeras, jis yra tarp kalnų šiaurėje nuo Patras įlankos.