Store områder av Svalbard-skjærgården er beskyttet. . Allerede i 1932 ble de to første floravernområdene etablert. I 2005 var det seks nasjonalparker, 21 naturreservater (inkludert de 15 spesielle fuglereservatene) og en beskyttet geotop.
I tillegg ble flere av de beskyttede områdene utvidet fra 1. januar 2004 på grunn av utvidelsen av norsk territorialfarvann fra 4 til 12 nautiske mil.
Foreløpig beskyttede områder utgjør totalt 39.000 km2 på land og 76.000 km2 til sjøs. Nasjonalparker er åpne for utendørs fritidsaktiviteter som ikke krever bruk av motorvogner. I spesielle tilfeller, for eksempel av vitenskapelige årsaker, kan guvernørens kontor tillate bruk av snøscootere, fly eller helikoptre.
I henhold til Svalbard Environmental Protection Act er ethvert spor av menneskelig aktivitet fra 1945 eller tidligere beskyttet som en del av kulturarven.