Aby odwiedzić Kaplica San Aquilino musimy uzyskać dostęp do wnętrza Bazylika San Lorenzo Maggiore. To coś więcej niż kaplica, w rzeczywistości jest to małe sanktuarium z V wieku, połączone z bazyliką małymi drzwiami wewnątrz kościoła. Został zbudowany jako cesarskie miejsce pochówku, biorąc pod uwagę obecność sarkofagu, który według niektórych uczonych mógł zostać wykonany dla jednego z synów Teodozjusza I.
Za jego czasów całe atrium łączące bazylikę z tą kaplicą było pełne mozaik. Nadal można zobaczyć pewne fragmenty, wśród których zidentyfikowano niektóre postacie apostołów i patriarchów plemion Izraela. Ich niezwykła jakość, wyrazistość postaci i studium cieni robią wrażenie. Za wejściem znajduje się fresk przedstawiający Ukrzyżowanie z XIV wieku oraz portal z marmuru z Carrary, który prowadzi do kaplicy. Portal ten pochodzi z I wieku i jest doskonale zachowany. Jego dekoracja obejmuje motywy kwiatowe, ptaki, delfiny i różne bóstwa, takie jak Jowisz i Neptun.
Kaplica San Aquilino ma ośmioboczny plan i jest w całości pokryta polichromowanymi marmurami. Najstarszą częścią jest kopuła, która przykrywała już pierwotne pomieszczenie, choć jej dekoracja uległa zniszczeniu w XVII wieku ze względu na zły stan zachowania.
Duża część kaplicy jest pokryta mozaikami. Jeden z nich przedstawia Chrystusa wraz z jego uczniami i filozofami i pochodzi z VI wieku. W absydzie kaplicy jest jeszcze jeden, w którym apostołowie siedzą półkolem wokół centralnej postaci Chrystusa, który ma u swoich stóp pojemnik ze zwojami Pisma Świętego. Wyraźne odniesienie do jego podwójnego statusu Króla i Mistrza.