Două dintre cele mai importante parcuri naționale din țară își fac prezența în departamentul guajira, Los Flamencos Flora and Fauna Sanctuary, Și Parcul Natural Național Macuira; transformând această regiune într-un reper pentru practica ecoturismului.
În Los Flamencos Flora and Fauna Sanctuary de exemplu, turiștii se bucură de un pământ de lagune de coastă udat de pâraie care alimentează păsările care dau exact locului numele, flamingo-urile.
El Parcul Natural Național Macuira Este o adevărată oază în mijlocul deșertului, un ecosistem de mare biodiversitate, găzduind numeroase specii de maimuțe, tigrillos, pisica brună, căprioare, guacharacas, mere și păsări albastre, printre altele.