Druga pomembna lizbonska cerkev je cerkev sv Sveti Antun (Igreja de Santo António de Lisboa), ki je posvečena svetemu Antoniju iz Lizbone, ki je po vsem krščanskem svetu bolj znan kot sveti Antun Padovanski. Po izročilu je bila cerkev zgrajena na kraju, kjer se je svetnik rodil, leta 1195.
Zgodovina pripoveduje, da se je Fernando de Bulhões, sveti Anthony, rodil v Lizboni leta 1195, sin bogate družine. Leta 1220 je med študijem v Coimbri vstopil v frančiškanski red in sprejel ime Antonio. Misijonska potovanja so ga vodila v Italijo, kjer se je naselil v Padovi. Zaradi izjemne priljubljenosti je bil kanoniziran manj kot leto dni po smrti, 1232.
Mesto družinske hiše, kjer se je rodil Fernando, ki se nahaja v neposredni bližini lizbonske katedrale, je bilo v 15. stoletju spremenjeno v majhno kapelico. Ta zgodnja stavba, od katere ni ostalo nič, je bila obnovljena v 16. stoletju, v Kralj Manuel I.
Leta 1730 je bila v času vladavine Janeza V. cerkev obnovljena in preurejena. V lizbonskem potresu leta 1755 je bila cerkev Santo António uničena in še vedno je stala samo glavna kapela. Po letu 1767 je bil popolnoma obnovljen po baročno-rokokojski zasnovi arhitekta Mateusa Vicenteja de Oliveire. To je cerkev, ki jo lahko obiščete danes.
Od leta 1755 procesija zapusti cerkev vsako 13. junija, mimo lizbonske katedrale in skozi pobočja soseske Alfama v bližini.
Treba je opozoriti, da je 12. maja 1982 cerkev obiskal papež Janez Pavel II. Nato so na trgu pred cerkvijo odprli kip svetega Antona (kipar Soares Branco) in molili v kripti, ki označuje kraj, kjer se je svetnik rodil.
