Čeprav arhipelag sestavlja več kot 7 tisoč otokov, lahko Filipine združimo v tri velike skupine otokov: Luzon, Visayas in Mindanao.
V več kot 300 tisoč kilometrih razširitve je država organizirana v te tri velike skupine, ki nato združujejo vrsto pomembnih provinc in krajev, kot sta Maniña ali Cebu. Vsaka skupina pa svoje ime dolguje najpomembnejšim otokom na posameznem območju, to je Luzon, Visayas in MindanaoOziroma.
Ti trije otoki so glavna središča Filipinov in tam so najpomembnejša mesta. Od severa proti jugu ima Mindanao približno 20 milijonov prebivalcev in glavno mesto, Davao, je eno najvidnejših mest v državi. V središču arhipelaga so Visayas, otok s približno 15 milijoni prebivalcev, od katerih jih je več s svojimi domovi v Cebuju, glavnem mestu otoka. Na koncu je še otok Luzon, kjer se nahaja Manila, glavno mesto države, pa tudi Quezon City, ki je mesto z najvišjim indeksom prebivalstva na Filipinih. Ta otok je poleg tega, da je protagonist geografske sheme, najbolj naseljen v državi.
Različni regijah Filipinov Ponujajo drugačno pokrajino in izredno turistično zanimanje, vendar so najpomembnejša mesta v vsaki regiji tista, ki pritegnejo največ pozornosti, hkrati pa so najbolj obiskana s strani turistov z vsega sveta. Med najpomembnejša mesta na Filipinih so Calambá, Laguna, Legazpi, Koronadal, Cotabato del Sur, Leyte, Cotabato, Lapu Lapu in Córdova.