Ang mga ninuno ng mga Inca ay mga mangangaso na nagmula sa Asya na tumatawid sa Bering Strait. Higit sa 20.000 taon na ang nakalilipas ang Bering Strait na kumokonekta sa Siberia at Alaska, tumagal ng ilang libong taon upang punan at lumikha ng mga sibilisasyon sa Amerika.
Ayon sa pananaliksik, nalalaman na sa pagitan ng 13.000 at 10.000 BC nakarating sila sa baybayin ng Pasipiko ng Timog Amerika at mga bundok ng Andes kung saan sila nanirahan at nakakita ng isang bagong pamumuhay. Natutunan nilang palaguin ang mga halaman tulad ng mais at patatas bilang karagdagan sa pagtataas ng llamas at alpacas. Nangyari ito sa pagitan ng 3000 at 2500 BC.
At bandang 8000 BC, nagsimulang umunlad ang mga kultura ng pre-Inca sa Andes at sa baybayin; Si Caral at Kotosh ay isa sa mga unang kilalang kultura sa larangang ito. Sinundan sila Chavín, Paracas, Nazca, Moche, Tiahuanaco, Wari at Chimú. Sa pagitan ng 1150 at 1250BC ang Incas, pagkatapos ay isang maliit na tribo, ay naghahanap ng bukirin na matatagpuan sa mayabong mga lambak ng Cusco.
Pinangibabawan at pinagbuti nila ang mga nagawa ng kanilang mga ninuno sa pamamagitan ng paglikha ng pinakamalaking sibilisasyong pre-Columbian sa Amerika, ang sibilisasyong Inca. Ang mga Inca na kanilang pinagmulan ay ipinaliwanag sa pamamagitan ng mga alamat, ang pinakakilala ay ang alamat nina Manco Cápac at Mama Ocllo na lumitaw mula sa Lake Titicaca at ang alamat ng mga kapatid na Ayar.
Mula bandang 1200 hanggang 1438 ang mga Inca ay isang maliit na tribo na unti-unting lumaki sa isang Imperyo. Ngunit ano ang naging sanhi ng pagbagsak ng isang advanced na sibilisasyon?
Ang pagsalakay sa mga Espanyol ay nagdala ng giyera at sakit sa parehong oras ng isang kultura na sumira sa lokal, na nagpapataw ng sarili nitong sistema ng paniniwala at gobyerno. Bago pa man dumating ang mga Espanyol sa teritoryo ng Inca, ang sakit ay kumalat mula sa Gitnang Amerika hanggang sa Timog Amerika. Pinaniniwalaan na sa sampung taon sa pagitan ng 50% at 90% ng populasyon ay inatake ng mga sakit tulad ng bulutong, trangkaso, tipus, dipterya, bulutong-tubig at tigdas kung saan ang populasyon ng Inca ay walang kaligtasan sa sakit.
Habang patungo ang mga Espanyol sa hilagang teritoryo ng Inca ay nakasalubong nila ang isang nabawasan at mahina na populasyon. Dumating si Francisco Pizarro sa lungsod ng Cajamarca noong 1532 kasama ang 110 armadong kalalakihan at isang kabalyerya. Doon, dinakip nila at pinatay ang Inca Atahualpa noong Agosto 29, 1533.