Šiandien save laiko maždaug 90 milijonų žmonių Budistai Japonijoje. Budizmas buvo įvežtas į Japoniją per Kiniją ir Korėją kaip dovaną iš Korėjos draugystės karalystės Kudaros (Paikche) VI a. Nors valdantieji didikai palankiai priėmė budizmą kaip naują Japonijos valstybinę religiją, dėl sudėtingų teorijų jis iš pradžių nebuvo paplitęs tarp paprastų žmonių.
Taip pat kilo keletas pradinių konfliktų su šintoistu - gimtąja Japonijos religija. Dvi religijos, kurios netrukus sugebėjo sugyventi ir netgi papildyti viena kitą. Naros laikotarpiu didieji Naros sostinės budistų vienuolynai, tokie kaip Todaiji, įgijo stiprią politinę įtaką ir buvo viena iš priežasčių, kodėl vyriausybė 784 metais sostinę perkėlė į Nagaoką, o po to į 794 m.
Tačiau politiškai ambicingų ir kovingų vienuolynų problema išlieka pagrindine vyriausybių problema per daugelį šimtmečių Japonijos istorijos. Ankstyvuoju Heiano laikotarpiu iš Kinijos buvo pristatytos dvi naujos budistų sektos: Tendai sekta 805 metais Saicho ir sekta Šingonas 806 metais Kukai. Vėliau daugiau sektų išsiskyrė su „Tendai“ sekta. Tarp jų svarbiausi yra paminėti toliau:
1175 m Jodo sekta (Grynosios žemės sektą) įkūrė Honenas. Jis rado pasekėjų tarp skirtingų socialinių klasių, nes jo teorijos buvo paprastos ir pagrįstos principu, kad kiekvienas žmogus gali pasiekti išganymą tikėdamas Amida Budu.
Ir 1191 m Dzeno sekta Jis buvo pristatytas iš Kinijos. Jo sudėtingos teorijos buvo ypač populiarios karinės klasės atstovams. Remiantis dzeno mokymais, galima pasiekti savęs apšvietimą meditacijos ir drausmės dėka. Šiandien atrodo, kad „Zen“ užsienyje labiau populiarėja nei Japonijoje.
Taip pat yra Nichireno sekta, kurią įkūrė Nichirenas 1253 m. Sektos buvo išskirtinės dėl netolerancijos požiūrio į kitas budizmo sektas. Ničireno budizmas ir šiandien turi daug milijonų pasekėjų, o kelios „naujos religijos“ remiasi Nichireno mokymais.