Два найважливіших національних парки країни мають свою присутність у департаменті Гуаджіра, то Заповідник флори та фауни Лос ФламенкосІ Національний природний парк Макуйра; перетворення цього регіону на орієнтир для практики екотуризму.
В Заповідник флори та фауни Лос Фламенкос наприклад, туристи насолоджуються країною прибережних лагун, поливаються струмками, які постачають птахів, які точно дають цьому місцю назву - фламінго.
El Національний природний парк Макуйра Це справжній оазис посеред пустелі, екосистема великого біорізноманіття, де проживають численні види мавп, тигрильов, бурий кіт, олень, гуачаракас, дрозд і синій птах.