Sot rreth 90 milion njerëz e konsiderojnë veten e tyre Budistët në Japoni. Budizmi u importua në Japoni përmes Kinës dhe Koreve në formën e një dhurate nga mbretëria koreane e miqësisë Kudara (Paikche) në shekullin e 6-të. Megjithëse Budizmi u prit në mënyrë të favorshme nga fisnikët në pushtet si feja e re shtetërore e Japonisë, ai nuk ishte përhapur fillimisht mes njerëzve të thjeshtë, për shkak të teorive të tij komplekse.
Pati gjithashtu disa konflikte fillestare me Shinto, fenë vendase të Japonisë. Dy fetë që shpejt ishin në gjendje të bashkëjetojnë, madje edhe plotësojnë njëra-tjetrën. Gjatë Periudhës Nara, manastiret e mëdhenj Budistë në kryeqytetin e Naras, të tilla si Todaiji, fituan një ndikim të fortë politik dhe ishin një nga arsyet që qeveria të zhvendosë kryeqytetin në Nagaoka në 784 dhe më pas në Kioto në 794..
Sidoqoftë, problemi i manastireve politikisht ambiciozë dhe luftarakë mbetet një çështje kryesore për qeveritë gjatë shumë shekujve të historisë japoneze. Gjatë periudhës së hershme Heian, dy sekte të reja Budiste u prezantuan nga Kina: Sekti Tendai në vitin 805 nga Saicho dhe sekt shingon në 806 nga Kukai. Më shumë sekte u ndanë më vonë me sektin Tendai. Ndër këto, më të rëndësishmet përmenden më poshtë:
Në 1175, Sekt Jodo (Sekti i Tokës së Pastër) u themelua nga Honen. Ai gjeti ndjekës midis klasave të ndryshme shoqërore, pasi teoritë e tij ishin të thjeshta dhe bazoheshin në parimin se të gjithë mund të arrijnë shpëtimin me forcën e besimit në Amida Buda.
Dhe në 1191, Sekti Zen Wasshtë prezantuar nga Kina. Teoritë e tij të komplikuara ishin veçanërisht të njohura për anëtarët e klasës ushtarake. Sipas mësimeve të Zenit, dikush mund të arrijë vetë-ndriçimin përmes meditimit dhe disiplinës. Sot, Zen duket se gëzon popullaritet më të madh jashtë vendit sesa brenda Japonisë.
Ekziston edhe Sekti Nichiren, themeluar nga Nichiren në 1253. Sekti ishte i jashtëzakonshëm për shkak të qëndrimit të tij të intolerancës ndaj sekteve të tjera Budiste. Budizmi Nichiren ende ka shumë miliona ndjekës sot dhe disa "fe të reja" bazohen në mësimet e Nichiren.