Megjithëse arkipelagu përbëhet nga më shumë se 7 mijë ishuj, Filipinet mund të grupohen në tre grupe të mëdha ishujsh: Luzon, ishujt Visayas dhe ishujt Mindanao.
Gjatë shtrirjes së tij më shumë se 300 mijë kilometra, vendi është i organizuar në këto tre grupe të mëdha që nga ana tjetër mbledh së bashku një sërë provincash dhe lokalitetesh të rëndësishme, të tilla si Maniña ose Cebu. Nga ana tjetër, secili grup ia ka borxh emrin e tij ishujve më të rëndësishëm në secilën zonë, domethënë, Luzon, Visayas dhe MindanaoPërkatësisht.
Këto tre ishuj janë qendrat kryesore të Filipineve dhe ku ndodhen qytetet më të rëndësishme. Nga veriu në jug, Mindanao ka rreth 20 milion banorë dhe kryeqytetin e tij, Davao, është një nga qytetet më të spikatur në vend. Në qendër të arkipelagut është Visayas, një ishull që ka rreth 15 milion banorë, shumë prej tyre me shtëpitë e tyre në Cebu, kryeqyteti i ishullit. Më në fund, është ishulli Luzon, i cili është vendi ku ndodhet Manila, kryeqyteti i vendit, si dhe Qyteti Quezon, i cili është qyteti me indeksin më të lartë të popullsisë në Filipine. Ky ishull si dhe protagonist në skemën gjeografike, është më i populluari në vend.
E ndryshme rajone të Filipineve Ato ofrojnë një peizazh tjetër dhe me interes të madh turistik, megjithatë, janë qytetet më të rëndësishme në secilin rajon që tërheqin më shumë vëmendjen, duke qenë në të njëjtën kohë më të vizituarat nga turistët nga e gjithë bota. Midis qytetet më të rëndësishme në Filipine ata janë Calambá, Laguna, Legazpi, Koronadal, Cotabato del Sur, Leyte, Cotabato, Lapu Lapu dhe Córdova.